Kapitein Frank Ramsey en eerste officier Ron Hunter komen tijdens hun missie met de onderzeeër USS Alabama in een wereldconflict terecht. Ze zijn onderweg naar de voormalige Sovjet-Unie op het moment dat daar een militaire staatsgreep plaatsvindt. Aan boord hebben ze voldoende nucleaire wapens om een Derde Wereldoorlog te ontketenen. Het conflict escaleert al snel en het ondenkbare gebeurt: de Alabama krijgt de opdracht om zijn wapens te lanceren. De opdracht wordt echter niet bevestigd en er ontstaat ruzie tussen Ramsey, die de opdracht wil uitvoeren, en Hunter, die wil wachten op de bevestiging.